به منظور برنامه‌ريزي و تنظيم جلسات شوراي عالي، ابلاغ و ارسال تصميمات و مصوبات شورا، ايجاد هماهنگي و تشكيل كميته‌هاي تخصصي، ثبت و ضبط موضوعات و ارجاع آن به كميته‌هاي تخصصي (با نظر رئيس شوراي عالي) و ساير امور اجرايي، دبيرخانه شوراي عالي در مركز فناوري اطلاعات نهاد رياست جمهوري تشكيل مي‌شود. رييس اين شورا معاون اول رئيس جمهور خواهد بود.

، تدوين نظام ملي امنيت فضاي تبادل اطلاعات كشور، بررسي ضوابط نظام‌دهي تحقيقات در حوزه امنيت قضايي تبادل اطلاعات و سياستگذاري، هماهنگي و نظارت بر اجراي سياست‌هاي امنيت فضايي تبادل اطلاعات كشور از جمله وظايف اين شوراست.
هيئت وزيران به استناد اصل يكصد و سي و هشتم قانون اساسي جمهوري اسلامي ايران در تاريخ سيزدهم اسفند سال 82 شوراي عالي امنيت فضاي تبادل اطلاعات كشور را تصويب كرد .

اين مصوبه در تاريخ 6 مرداد ماه با موافقت معاونت اول رييس‌جمهور از طبقه‌بندي محرمانه خارج شده است كه متن كامل آن در پي مي‌آيد :
1- به منظور حفظ و صيانت از فضاهاي تبادل اطلاعات كشور، كاهش مخاطرات و حداقل نمودن خرابيها، كاهش زمان تجديد حيات سيستم‌هاي آسيب‌ديده و ايجاد امنيت در حوزه‌هاي مختلف از قبيل امنيت، آب، غذا و نيازمندي‌هاي اوليه، انرژي (الكتريكي اتمي و سوختهاي فسيلي) خدمات اورژانس (آتش نشاني، پزشكي و پليسي) اقتصاد، تجارت و امور مالي و اعتباري، رسانه‌ها ، ارتباطات و اطلاعات و حمل و نقل (جاده‌اي، ريلي، دريايي و هوايي)، شوراي عالي امنيت فضاي تبادل اطلاعات كشور كه در اين تصويب‌نامه به اختصار شوراي عالي ناميده مي‌شود، با تركيب زير تشكيل مي‌گردد:

ب ـ رئيس سازمان مديريت و برنامه‌ريزي كشور
پ ـ وزير اطلاعات
ت‌ـ وزير دفاع و پشتيباني نيروهاي مسلح
ث ـوظائف وزير ارتباطات و فناوري اطلاعات
ج ـ وزير فرهنگ و ارشاد اسلامي
چ ـ دبير شوراي عالي اطلاع‌رساني
ح ـ رئيس مركز فناوري اطلاعات نهاد رياست جمهوري (دبير شوراي عالي )
خ ـ دو نفر متخصص در زمينه امنيت فضاي تبادل اطلاعات به انتخاب رئيس شوراي عالي
د ـ رؤساي دستگاههاي اجرايي بر حسب مورد با حق راي

2- وظايف شوراي عالي به شرح زير است:
الف‌ـ‌ بررسي طرح‌هاي كلان ملي در زمينه امنيت فضاي تبادل اطلاعات
ب ـ تدوين نظام ملي امنيت فضاي تبادل اطلاعات كشور
پ ـ بررسي استانداردهاي پيشنهادي كميته‌هاي تخصصي
ت ـ تدوين اسناد راهبردي ملي و ارائه به مراجع قانوني
ث ـ تدوين سياست‌هاي مربوط به همكاريهاي منطقه‌اي و بين‌المللي
ج ـ تدوين لوايح تنظيمي جهت ارائه به هيئت وزيران
دـ بررسي ضوابط نظام‌دهي تحقيقات در حوزه امنيت قضايي تبادل اطلاعات
هـ ـ بررسي و پيشنهاد اعتبار مورد نياز جهت اجراي سياست‌هاي موضوع اين آيين‌نامه و ارائه آن به مراجع ذيربط
و ـ سياستگذاري، هماهنگي و نظارت بر اجراي سياست‌هاي امنيت فضايي تبادل اطلاعات كشور
تبصره ـ تصميمات و مصوبات شورا در چارچوب موضوعاتي كه مطابق قوانين تصميم‌گيري در مورد آنها برعهده هيئت وزيران است، پس از تاييد شوراي عالي به تصويب هيئت وزيران خواهد رسيد.

3ـ با توجه به ميزان توسعه و به كارگيري فناوري اطلاعات و ارتباطات در حوزه‌هاي حياتي موضوع بند (1) و درجه حساسيت، نوع مشكلات، انگيزه‌هاي آسيب‌رساني به حوزه‌هاي مزبور دامنه اثر و تفاوت‌هاي محيطي و ضرورت بررسي كارشناسي موارد فوق كميته‌هاي تخصصي به شرح زير تشكيل مي‌شوند:
الف ـ اعضاي كميته تخصصي امنيت فضاي تبادل اطلاعات در امور دفاعي و امنيتي
1ـ وزارت اطلاعات
2ـ وزارت كشور
3ـ وزارت دفاع و پشتيباني نيروهاي مسلح
4ـ وزارت امور خارجه
5ـ وزارت ارتباطات و فناوري اطلاعات
6ـ يك نفر متخصص به انتخاب رئيس شوراي عالي
ب ـ اعضاي كميته تخصصي امنيت فضاي تبادل اطلاعات خدماتي
1ـ وزارت راه وترابري
2ـ وزارت نيرو
3ـ وزارت نفت
4ـ وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشكي
5ـ وزارت ارتباطات و فناوري اطلاعات
6ـ يك نفر متخصص به انتخاب رئيس شوراي عالي
پ ـ اعضاي كميته تخصصي امنيت فضاي تبادل اطلاعات اقتصادي و تجارتي
1ـ وزارت بازرگاني
2ـ وزارت امور اقتصادي و دارايي
3ـ وزارت صنايع و معادن
4ـ وزارت ارتباطات و فناوري اطلاعات
5ـ بانك مركزي جمهوري اسلامي ايران
6ـ يك نفر متخصص به انتخاب رئيس شوراي عالي
ت ـ اعضاي كميته تخصصي امنيت ارتباطات و اطلاعات فضاي تبادل اطلاعات عمومي
1ـ وزارت ارتباطات و فناوري اطلاعات
2ـ وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامي
3ـ وزارت دادگستري
4ـ وزارت علوم، تحقيقات و فناوري
5ـ سازمان صدا و سيماي جمهوري اسلامي ايران
6ـ يك نفر متخصص به انتخاب رئيس شوراي عالي

4ـ اهم وظايف كميته‌هاي تخصصي به شرح زير است:
الف ـ تهيه گزارش بررسي وضعيت موجود امنيت فضاي تبادل اطلاعات در بخش‌هاي حياتي مرتبط به كميته‌ها حسب مورد با مشاركت بخش مربوط
ب ـ استخراج جدول اولويت مربوط به امن‌سازي بخش‌هاي حياتي حسب شرايط موجود
پ ـ تهيه دستورالعمل و برنامه كاري امنيت فضاي تبادل اطلاعات هر يك از بخش‌هاي حياتي
ت ـ تهيه طرح و اولويت‌هاي كاري در كليه بخش‌هاي غيرحياتي كشور اعم از دولتي و خصوصي
ث ـ بررسي و ارائه راه‌حل براي مشكلات خاص مبتلا به ملي
ج ـ بررسي و پيشنهاد براي نظام اجرايي مناسب جهت تحق مصوبات وخواسته‌هاي كلان
چ ـ پيشنهاد ضوابط نظام‌دهي تحقيقات در حوزه امنيت فضاي تبادل اطلاعات
5ـ به منظور ايجاد هماهنگي، يكپارچه‌سازي و تلفيق پيشنهادهاي ارائه شده از سوي كميته‌هاي تخصصي و ارائه آن به شوراي عالي، كميته راهبري تشكيل مي‌گردد. اعضاي اين كميته توسط رئيس شوراي عالي انتخاب خواهند شد.
6ـ به منظور برنامه‌ريزي و تنظيم جلسات شوراي عالي، ابلاغ و ارسال تصميمات و مصوبات شورا با رعايت تبصره ذيل بند (2)، ايجاد هماهنگي و تشكيل كميته‌هاي تخصصي، ثبت و ضبط موضوعات و ارجاع آن به كميته‌هاي تخصصي (با نظر رئيس شوراي عالي) و ساير امور اجرايي، دبيرخانه شوراي عالي در مركز فناوري اطلاعات نهاد رياست جمهوري تشكيل مي‌شود.
7ـ آيين‌نامه نحوه تشكيل شوراي عالي و كميته‌هاي تخصصي و نحوه رسيدگي به موضوعات در شوراي عالي و كميته‌هاي تخصصي ياد شده به تصويب شوراي عالي مي‌رسد.